Servicios Científico-Técnico
Proteómica y Bioquímica Dorothy Hodgkin
1. Definición del servicio
La Plataforma de Proteómica y Bioquímica Dorothy Hodgkin realiza diversos trabajos y estudios con proteínas desde una perspectiva multidisciplinar. Los servicios ofrecidos abarcan desde el análisis de proteomas hasta la purificación de proteínas a la carta, pasando por la caracterización de interacciones intermoleculares o la detección y cuantificación de proteínas en muestras biológicas.
2. Servicios ofrecidos
- Análisis de muestras por electroforesis SDS-PAGE (1 o 2 dimensiones)
- Ensayos de Western Blotting (detección y cuantificación de proteínas)
- Ensayos y análisis de electroforesis en gel diferencial (DIGE)
- Purificación de proteínas recombinantes a la carta
- Puesta a punto de producción de proteínas
- Estudio de interacciones moleculares (SPR o ITC)
- Caracterización de actividades enzimáticas
- Asistencia técnica en el diseño y realización de experimentos con proteínas
- Cuantificación de proteínas
- Análisis de proteomas (con o sin enriquecimiento)
3. Personal y contacto
Responsable de la plataforma:
Dra Laura Tomás Gallardo – 954978208
Técnicos asociados:
Cynthia Alias Villegas
4. Equipamiento
- Sistema de imagen ChemiDoc MP
- Espectrofotómetro UV-Vis Shimadzu UV-1280
- Escáner Image scanner III (Cytiva)
- Escáner Láser Amersham Typhoon RGB (Cytiva)
- Sistemas de electroforesis
- IPGPhor (Cytiva)
- Sonicador Branson SFX 550
- Biacore X100 (Cytiva)
- Nanocalorímetro PEAQ-ITC (MicroCal – Malvern)
- Cabina de flujo laminar Cruma HZ-2
- Microcentrífuga 5415R (Eppendorf)
- Incubado Innova 42 (New Brunswick- Eppendorf)
- Sistema de transferencia Trans-Blot Turbo (BioRad)
- ÄKTA™ Pure 25 FPLC (Cytiva)
- Liofilizador Telstar LyoQuest -85
5. Tarifas
| Servicios ofertados | TARIFA | |||
| CABD | Universidades y OPIs | Empresas/Otros | ||
| CONSUMO DE REACTIVOS | ||||
| Electroforesis 1-D | Gel pequeño (8 x 7 cm) | 11,50 € | 16,50 € | 22,50 € |
| Gel mediano (10-18 x 22 cm) | 22,50 € | 32,50 € | 42,50 € | |
| Tinción | Azul de Coomassie modificado | 5,50 € | 6,50 € | 7,50 € |
| Plata | 6,50 € | 7,50 € | 8,50 € | |
| Imidazol | 4,50 € | 5,00 € | 5,50 € | |
| Cuantificación de proteínas | Densitometría (gel pequeño) | 15,50 € | 19,50 € | 23,50 € |
| Lowry (Kit RC-DC) | 5,50 €/ muestra | 7,50 €/ muestra | 9,50 €/ muestra | |
| USO DE EQUIPOS | ||||
| FPLC (ÄKTA pure) | 11,50 €/ día | 16,50 €/ día | 22,50 €/ día | |
| SPR (Biacore X-100) | 16,50 €/ día | 27,50 €/ día | 35,50 €/ día | |
| Liofilizador | 1,00€/h | 1,50€/h | 2,00€/h | |
| Ultracentrífuga | 2,00€/h | 2,50€/h | 3,00€/h | |
| ITC (Malvern PEAQ-ITC) | 16,50 €/ día | 27,50 €/ día | 35,50 €/ día | |
| TÉCNICAS | ||||
| Preparación de muestras | 10,50 € | 15,50 € | 20,50 € | |
| Purificación de proteínas recombinantes en bacterias | Tipo A | 325,00 € | 400,00 € | 477,00 € |
| Tipo B | 630,00 € | 782,00 € | 931,00 € | |
| Tipo C | 782,00 € | 1.035,00 € | 1.543,00 € | |
| Western Blotting | 26,00 € | 36,00 € | 46,00 € | |
| Electroforesis 2-D | Minigel | 26,00 € | 36,00 € | 46,00 € |
| Midigel | 41,00 € | 71,00 € | 91,00 € | |
| Maxigel | 61,00 € | 112,00 € | 132,00 € | |
| DIGE | DIGE maxigel | 304,00 € | 408,00 € | 510,00 € |
| Análisis de imagen (DeCyder) | 30,00 €/h | 40,00 €/h | 50,00 €/h | |
| Ensayos de Interacción | SPR | 500,00 € | 650,00 € | 875,00 € |
| ITC | 110,00 € | 150,00 € | 300,00 € | |
| DISEÑO EXPERIMENTAL | ||||
| Puesta a punto en producción | 25,00 €/h | 30,00 €/h | 35,00 €/h | |
| Asesoramiento técnico | 25,00 €/h | 30,00 €/h | 35,00 €/h | |
| Trabajo de personal técnico | 45,00 €/h | 50,00 €/h | 60,00 €/h | |
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1 SOLICITAR PRESUPUESTO SEGÚN CARACTERÍSTICAS DEL EXPERIMENTO
2 Incluye, lisis, inhibidores de proteasas, limpieza y cuantificación.
3 Incluye electroforesis, transferencia, detección y análisis de imagen. El usuario aportará el anticuerpo.
4 Incluye tinción del gel.
6. Publicaciones y Recursos web
Publicaciones:
- Fine-Tuning Modulation of Oxidation-Mediated Posttranslational Control of Bradyrhizobium diazoefficiens FixK(2) Transcription Factor. Int. J. Mol. Sci. 2022, 23, 5117. https://doi.org/10.3390/ijms23095117
- Optimized CRISPR-RfxCas13d system for RNA targeting in zebrafish embryos. STAR Protocols, 2022, 3, 101058. https://doi.org/10.1016/j.xpro.2021.101058
- Dissection of FixK(2) protein-DNA interaction unveils new insights into Bradyrhizobium diazoefficiens lifestyles control. Environmental Microbiology, 2021, 23, 6194. https://doi.org/10.1111/1462-2920.15661
- CRISPR-Cas13d Induces Efficient mRNA Knockdown in Animal Embryos. Developmental Cell, 2020, 54, 805-817. https://doi.org/10.1016/j.devcel.2020.07.013
- The CbrB Regulon: Promoter dissection reveals novel insights into the CbrAB expression network in Pseudomonas putida. PLOS ONE, 2018, 13, e0209191. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0209191
- Searching for a Cell-Based Therapeutic Tool for Haemophilia A within the Embryonic/Foetal Liver and the Aorta-Gonads-Mesonephros Region. Thromb. Haemost., 2018, 118, 1370. https://doi.org/10.1055/s-0038-1661351
Recursos web:
- Transcription and Translation Tool: Converts sequences from DNA to RNA and from this to protein.
http://biomodel.uah.es/en/lab/cybertory/analysis/trans.htm
- ProtParam tool: allows the computation of various physical and chemical parameters for a given protein.
https://web.expasy.org/protparam/
- SnapGene Viewer: View, annotate and share plasmid sequence files.
https://www.snapgene.com/snapgene-viewer
- Expasy: Swiss Bioinformatics Resource Portal
- Uniprot: Base de datos de secuencias de proteínas e información funcional.
- Fold-It: Programa de ciencia ciudadana que permite contribuir a investigaciones científicas mediante una dinámica lúdica de plegamiento de proteínas.
- AlphaFold: Base de datos de estructuras de proteínas resueltas por IA.
CONTACTO
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