Biología computacional y Bioinformática

Nuestra investigación se centra en el desarrollo y aplicación de métodos de inteligencia artificial para construir representaciones computacionales de entidades biológicas, incluyendo proteínas, genes, regiones reguladoras, células y organismos. Estas representaciones transforman objetos biológicos complejos en espacios numéricos donde pueden compararse, organizarse y analizarse mediante herramientas matemáticas y computacionales.

El objetivo central es comprender qué información biológica contienen dichas representaciones. Así, estudiamos cómo propiedades como la función molecular, las relaciones evolutivas, la diversidad biológica o la organización de sistemas celulares están contenidas en estos espacios de representación, permitiendo explorar principios biológicos que no son evidentes a partir de los datos originales.

Otra parte de nuestro trabajo consiste en  desarrollan herramientas predictivas a partir de estas representaciones. Estos enfoques permiten transferir conocimiento entre proteínas, genes o células relacionadas, superando algunas de las limitaciones de los métodos tradicionales basados exclusivamente en similitud de secuencia u homología.

Finalmente, estas representaciones se utilizan como herramientas para abordar preguntas fundamentales en biología evolutiva y funcional. Entre ellas se incluyen el estudio de la convergencia evolutiva, la aparición de nuevas funciones biológicas, la organización del espacio funcional de las proteínas o la identificación de patrones evolutivos a gran escala. El objetivo último es utilizar la inteligencia artificial no solo como una herramienta predictiva, sino también como un marco para comprender cómo se organiza y evoluciona la información biológica.